Die Vertreter der verschiedenen Disziplinen der Katholischen Theologie haben jeweils Arbeitsgemeinschaften gebildet: 

• Altes Testament
• Neues Testament
• Kirchengeschichte
• Philosophie
• Dogmatik und Fundamentaltheologie 
• Moraltheologie
• Christliche Sozialethik
• Pastoraltheologie
• Religionspädagogik und Katechetik
• Homiletik
• Liturgiewissenschaft
• Kirchenrecht
• Missions- und Religionswissenschaft

Neben den Arbeitsgemeinschaften gibt es folgende Gremien und Zusammenschlüsse:

• KTHF - Katholisch-Theologischer Fakultätentag
• AGENDA - Forum katholischer Theologinnen
• Arbeitsgemeinschaft der Ordenshochschulen – AGO
• Arbeitsgemeinschaft Studierende der Katholischen Theologie in Deutschland – AGT
• Bundeskonferenz der wissenschaftlichen Assistentinnen und Assistenten, Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter für katholische Theologie
• Europäische Gesellschaft für Katholische Theologie
• International Network of Societies for Catholic Theology - INSeCT
• Konferenz der Dekane und Dekaninnen an Katholisch-Theologischen Fachhochschul-Fachbereichen 

Nachwuchsnetzwerke

• Forum Kirchenrecht
• Netzwerk Moraltheologie
• Nachwuchsnetzwerk Dogmatik und Fundamentaltheologie
• Forum Sozialethik
• AKL-Junior (Liturgiewissenschaft)
• Arbeitsgemeinschaft der Assistentinnen und Assistenten an bibelwissenschaftlichen Instituten in Österreich (ArgeAss)
• Arbeitsgemeinschaft neutestamentlicher Assistenten und Assistentinnen an theologischen Fakultäten (AG-Ass)